多元统计分析起源于医学和心理学。1928年Wishert发表论文《多元正态总体样本协方差阵的精确分布》，是多元统计分析的开端；20世纪30年代，费希尔（Fisher）、霍特林（Hotelling）、许宝碌等奠定了多元统计分析的理论基础；20世纪40年代，这一分析方法在心理学、教育学、生物学等方面有不少应用，但由于计算复杂且计算量大，其发展受到限制；20世纪50年代中期，随着计算机的出现和发展，多元统计分析方法在地质、气象、医学和社会学方面得到广泛应用，多元统计分析已渗入几乎所有的学科；到20世纪80年代后期，计算机软件包已很普遍，使用也方便，因此多元统计分析方法也更为普及，在我国受到各个领域的极大关注，近40多年在理论上和应用上都取得了若干新进展。
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