创世纪的第八天的笔记(11)

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第418页

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德尔布鲁克在诺贝尔颁奖典礼上的讲话：科学家和艺术家只有一点是共同的，他从世界上找不到更好的报偿，除了他的工作之外，他和世界就没什么更紧密的联系了。是这样么？莫诺在这个世界上的最后一句话：Je cherche á comprendre 这一句话不是已经给出了答案？没有谁比他们更亲近这个世界。 (更多)

德尔布鲁克在诺贝尔颁奖典礼上的讲话：科学家和艺术家只有一点是共同的，他从世界上找不到更好的报偿，除了他的工作之外，他和世界就没什么更紧密的联系了。
是这样么？
莫诺在这个世界上的最后一句话：Je cherche á comprendre
这一句话不是已经给出了答案？没有谁比他们更亲近这个世界。 (收起)

2011-03-10 20:26:51 2回应

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第454页

飞尘不沉 (“随缘惜缘不攀缘”)

科学中的黄金时代是什么样的？沃森和克里克对我说，首先的要求是科学必须是新生的，小的。在一个新领域开始时，那种小的规模是重要的。有关这点一个重要的方面是新领域的人是从其他研究方向转过来的。小规模使冲突的频率、智慧相互作用的强度达到最佳水平；各种不同来源的观点使思想交流的相互影响、范围和角度达到最佳水平。... 而且在新领域开始的时候，概念和实验更新鲜、更单纯，这意味着与实际支出相比，实际的研究经费很低。... (更多)

科学中的黄金时代是什么样的？沃森和克里克对我说，首先的要求是科学必须是新生的，小的。在一个新领域开始时，那种小的规模是重要的。有关这点一个重要的方面是新领域的人是从其他研究方向转过来的。小规模使冲突的频率、智慧相互作用的强度达到最佳水平；各种不同来源的观点使思想交流的相互影响、范围和角度达到最佳水平。... 而且在新领域开始的时候，概念和实验更新鲜、更单纯，这意味着与实际支出相比，实际的研究经费很低。伟大的原理通常会把畸形发展的复杂性外壳剔除而使理论大大简单化。沃森也提过，他很快地得到了博士学位，部分原因是有很多生物学，他没有花太多的工夫去学，因为他知道五年后那些知识就没用了，也许就不再是那么回事了。... 然而科学的黄金时代不仅是小规模、有分寸的要求和好的想法。一个真正的黄金时代也是单纯的年代。
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2011-07-24 06:21:57 回应

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第442页

Len (从心而居)

我们必须永远记住，最需要我们给出解答的是对起源的理解——人类的起源、生命本身的起源和生命的本质。这是公众非常想知道的。毕竟这证实了选择科学作为一种职业的光荣性。 (更多)

我们必须永远记住，最需要我们给出解答的是对起源的理解——人类的起源、生命本身的起源和生命的本质。这是公众非常想知道的。毕竟这证实了选择科学作为一种职业的光荣性。
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2012-04-11 13:47:59 回应

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第440页

Len (从心而居)

黄金年代、单纯的年代，跟随它的确实我们现在的无耻年代。整书都是这种伤感的对科学研究风格消失的感慨。 (更多)

黄金年代、单纯的年代，跟随它的确实我们现在的无耻年代。
整书都是这种伤感的对科学研究风格消失的感慨。 (收起)

2012-04-11 13:27:20 回应

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第26页

crystal_ym (quiet fire==!!!)

实验的基本方向是由德尔布鲁克和卢里亚在1940年底首次会面时直接制定的。细菌学家有时会被抗性现象所迷惑，抗性现象是一种偶然的现象，在大量对特殊噬菌体敏感的细菌中，会出现对此侵染不敏感的变异型细菌。微生物的活力惊人，这些在一亿次中出现两三次的对抗型细菌能够被鉴别，因为他们自身能抵抗噬菌体的侵染，并产生后代。40年代后前在抗菌素广泛使用时，更被人们熟悉的抗性型是某些细菌对青霉素和四环素等的抗性。现在就连普... (更多)

实验的基本方向是由德尔布鲁克和卢里亚在1940年底首次会面时直接制定的。细菌学家有时会被抗性现象所迷惑，抗性现象是一种偶然的现象，在大量对特殊噬菌体敏感的细菌中，会出现对此侵染不敏感的变异型细菌。微生物的活力惊人，这些在一亿次中出现两三次的对抗型细菌能够被鉴别，因为他们自身能抵抗噬菌体的侵染，并产生后代。40年代后前在抗菌素广泛使用时，更被人们熟悉的抗性型是某些细菌对青霉素和四环素等的抗性。
现在就连普通人也知道抗性细菌起源于突变，突变是稀有但可遗传的变化，这种变化使细菌得以生存并能够再生。但当德尔布鲁克和卢里亚在一起做实验时，传统的细菌学家对微生物遗传或者微生物中的自然选择一点也不清楚。当时许多人认为“抗性”是细菌适应有抗菌素的环境而诱导产生的；诱导的机制虽然不清楚，但可以想象这包括了巨大的代谢变化，所以很难成功，但一旦成功，它会将这些变化遗传给后代。这个想法符合孟德尔和达尔文之前的习得性遗传的概念。卢里亚曾嘲笑细菌学是“拉马克主义的大本营”。 (收起)

2011-12-06 22:42:00 回应

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第24页

crystal_ym (quiet fire==!!!)

德尔布鲁克对那些初始阶段的噬菌体实验做了描述：病毒是通过消灭细菌来显示自己的，就像一个小男孩吃掉一块蛋糕来宣布他的存在一样。我们对病毒的了解是建立在下列实验基础上的，这些实验只需要很简单的仪器设备并可以在一天内结束。首先让细菌在含有肉汤培养基的试管中生长，然后往试管中加入足够数量的病毒，至少每隔细菌能被一个病毒所吸附。在过了一段时间后（13分钟到40分钟间，根据病毒种类而定，但对任何特定种类的病毒... (更多)

德尔布鲁克对那些初始阶段的噬菌体实验做了描述：
病毒是通过消灭细菌来显示自己的，就像一个小男孩吃掉一块蛋糕来宣布他的存在一样。我们对病毒的了解是建立在下列实验基础上的，这些实验只需要很简单的仪器设备并可以在一天内结束。
首先让细菌在含有肉汤培养基的试管中生长，然后往试管中加入足够数量的病毒，至少每隔细菌能被一个病毒所吸附。在过了一段时间后（13分钟到40分钟间，根据病毒种类而定，但对任何特定种类的病毒来说，这个时间是一定的），细菌就被裂解并释放大量病毒。当细菌被裂解时，因为细菌生长而浑浊的试管突然又变得透明了。在显微镜下观察试管中的溶液时，看不见细菌了。 (收起)

2011-12-06 22:35:50 回应

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第13页

crystal_ym (quiet fire==!!!)

细菌在半周内繁殖的代数要比人类有史以来的总数还要多。细菌的繁殖是一分为二的分裂方式；许多病毒能以五十倍或者是上百倍的速度繁殖。细菌的所需要的食物十分简单，因此它们的食物可以完全地被认为控制。细菌的变异也很容易察觉，细菌学家或分子生物学家通常能从上亿说着更多的细胞中选出自己所需要的、带有特殊特征的变异株。世界上被了解最多的生物是人类的大肠杆菌。坚定细菌的实验结果比人们想象的要简单，通常连显微镜都... (更多)

细菌在半周内繁殖的代数要比人类有史以来的总数还要多。细菌的繁殖是一分为二的分裂方式；许多病毒能以五十倍或者是上百倍的速度繁殖。细菌的所需要的食物十分简单，因此它们的食物可以完全地被认为控制。细菌的变异也很容易察觉，细菌学家或分子生物学家通常能从上亿说着更多的细胞中选出自己所需要的、带有特殊特征的变异株。世界上被了解最多的生物是人类的大肠杆菌。坚定细菌的实验结果比人们想象的要简单，通常连显微镜都不需要：只是检查在那些易碎的低边缘的玻璃皿内的肉汤或明胶中生长的细菌，观察菌落的大小、颜色和纹理。
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2011-12-06 22:28:01 回应

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第414页

飞尘不沉 (“随缘惜缘不攀缘”)

更普遍和更有用的是肯德鲁对标准观念的看法。他在1963年第一次提出，分子生物学是两股分别叫做“信息和构象”的潮流的汇合。信息论是20世纪40年代和那以后的计划，人们期待数学家和物理学家用这个理论对分子生物学有所影响；然而事实上，它几乎完全没有发挥什么作用。也许，西拉德对发展控制酶生物合成的阻抑物模型的干预是个例外-那个干预由于其戏剧性，使它的实际应用很容易被夸大。但除此之外，后来信息论对分子生物学最大的用.. (更多)

更普遍和更有用的是肯德鲁对标准观念的看法。他在1963年第一次提出，分子生物学是两股分别叫做“信息和构象”的潮流的汇合。信息论是20世纪40年代和那以后的计划，人们期待数学家和物理学家用这个理论对分子生物学有所影响；然而事实上，它几乎完全没有发挥什么作用。也许，西拉德对发展控制酶生物合成的阻抑物模型的干预是个例外-那个干预由于其戏剧性，使它的实际应用很容易被夸大。但除此之外，后来信息论对分子生物学最大的用处就是作为一种谈论方式，来叙说那些不需要考虑原则就能做出的发现和模型。肯德鲁在回顾中用了“信息”。他所指的信息的含义首先是分子生物学的一半是起源于遗传学的，特别是微生物遗传，包括用遗传方法阐明生物化学途径和控制，像莫诺和雅各布所做的；其次，分子生物学的另一半起源于对生物大分子结构的研究，像鲍林和英国的晶体学家们最后对DNA和蛋白质结构和功能关系的阐明。这些潮流在最近被更精确地指为一维的（遗传的和顺序的）和三维的（立体化学或结构的）。从这方面来说，区别脱离了标准观念的限制而走向事物的难点所在。一维和三维之间的相互影响贯穿了全书。但从分子生物学早期历史的标准观念看，中心要素是10年或15年间对基因物质鉴定的斗争。... 分子生物学起源于五种完全不同学科的特别分支之综合。综合早在20世纪30年代中期就开始了，沃森和克里克将遗传学和X射线晶体学合并以及DNA结构的解决是那个综合接近成熟的胜利。综合中，每个学科在开始合并前，本身都在迅速发展。在这些学科中，我检测不出有用的抽象或还原层次，更检测不出任何一致的冲突模式。这些学科中有几个分支无疑是很重要的。物理化学是第二个。在鲍林的推动下，这门学科得到了迅速的发展，这种发展与英国劳伦斯布拉格的晶体学及其学派的发展紧密相关，并从后者那里获得了一些发展动力和一些细节。第三个学科是遗传学，它自身变成了生物化学。第四个学科是微生物学，20世纪40年代通过自身的一次转化而产生。第五门学科是生物化学，在同一些年份里其自身发生了革命。... 从20世纪30年代到60年代，生物学中更基本的转变是得出了专一性的观念。目前所说的生物学专一性有好几个前身。今天的三项考虑包含了所有其他的。首先是线性专一性。长链的生物大分子，无论是蛋白质还是核酸都有序列专一性。其次是结构专一性。生物大分子的特殊构型都有其专一的功能。这种结构与功能的配合性显然重申了一维的和三维结构的相互影响。第三个是线性专一性决定三维专一性。现在所说的生物学专一性意义，克里克在20世纪50年代中期提出序列假说时就第一次明确表达过了。
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2011-07-24 05:53:26 回应

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第298页

飞尘不沉 (“随缘惜缘不攀缘”)

问题主要在于，当你在一个根本不理解的领域做实验是，你对实验应该检查什么根本不清楚。实验分几种类别。有些实验你能够完全描绘，完全阐明，因此结果就必然会出现；实验会给你证明A或者B，两种形式的结果都是有意义的；你对世界的理解是如此完美，只有这两种结果。但大部分实验不具备这个特性。你对世界的理解不足以使你把答案限制在实验中。于是你做了实验，你盯着它说，它意味这什么吗，或者它建议什么我能够在今后的实验中得以... (更多)

问题主要在于，当你在一个根本不理解的领域做实验是，你对实验应该检查什么根本不清楚。实验分几种类别。有些实验你能够完全描绘，完全阐明，因此结果就必然会出现；实验会给你证明A或者B，两种形式的结果都是有意义的；你对世界的理解是如此完美，只有这两种结果。但大部分实验不具备这个特性。你对世界的理解不足以使你把答案限制在实验中。于是你做了实验，你盯着它说，它意味这什么吗，或者它建议什么我能够在今后的实验中得以加强吗？世界的真面貌是什么？信使实验有那种特性。我们不知道它应该看起来是什么，因此在你做实验时，你不知道你的结果中什么是假象，什么是现象。围绕这个题目的实验会有很长的时间。最后你学会了如何以某种方式来做实验：你发现了能够重复它们的方式，或者至少，如果它只是重复性那实际上是个糟糕的描述方式，一个不好的标准，因为你能很好地重复假象。在实验的很大范围内，现象要能够重复并且是相互关联的。参数变化范围很大，这样你就可以相信你理解了一些东西。这就是在信使实验中发生的：学会如何从细胞中得到某物，如何分离某物，如何避免。比方说，为了分离某物，你必须防止它被酶所破坏。即使要想做到这点，你必须很偶然地关注它，然后发现你所做的是什么，以看到它的重复性。因此创造现象有一整套条件。
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2011-07-24 04:14:25 回应

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第134页

飞尘不沉 (“随缘惜缘不攀缘”)

克里克说：“我用两种方式进行思考。一种是半夜时进行有趣的思考。比方说上星期这种情况就发生了，那是我们在研究遗传密码的时候.我说的半夜是-你凌晨3点钟醒来时，无法入睡，于是你就开始思考，很快活，那就是对它的解释！但是我谈话时思考也是真的... 我的同事在这方面有所不同。我认为在不和他人讨论时，沃森无法使他的想法清晰起来，他是那种头脑在紧急状态下工作的人，能做出有想象力的跳跃，他需要和他人谈话。 p138 .. (更多)

克里克说：“我用两种方式进行思考。一种是半夜时进行有趣的思考。比方说上星期这种情况就发生了，那是我们在研究遗传密码的时候.我说的半夜是-你凌晨3点钟醒来时，无法入睡，于是你就开始思考，很快活，那就是对它的解释！但是我谈话时思考也是真的... 我的同事在这方面有所不同。我认为在不和他人讨论时，沃森无法使他的想法清晰起来，他是那种头脑在紧急状态下工作的人，能做出有想象力的跳跃，他需要和他人谈话。 p138 正如常常指出的那样，分子生物学起源于两个学派，一个学派是结构和三维的，由英国X射线晶体学家和鲍林所组成。另一个学派是遗传的和一维的，主要是美国的噬菌体组。两个学派在DNA结构解决后壮观地走到一起。从那以后克里克因为他所选择的问题继续横跨两个方米纳，这是他显示其长期主导地位的另一种方式。但一个法国学派在早年也繁荣起来了。其特征是用微生物遗传学工具来认识不同类型概念的特征：在基因的信息表达之前，是基因所决定事件的相互作用及调节。
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2011-07-24 03:06:45 回应

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