本系列共六卷，前四卷建立了经济复杂性的基础数理模型，后两卷讨论经济复杂性的方法论和历史依据。

其中，第一卷《代谢增长论》发展了非线性决定论的生态经济学模型；
第二卷《内生周期论》发展了经济周期的色混沌模型；
第三卷《中观基础论》提出“微观—中观（金融和产业）—宏观”三层次的结构框架；
第四卷《生灭过程论》发展了描述宏观、金融波动随机论的非线性群体模型；
第五卷《交易成本和熵》讨论了交易成本演化的多样性和组织创新的不确定性；
第六卷《历史实验论》用历史案例作为检验经济学理论的自然实验。
我们把经济复杂性的研究应用于经济学的各个领域，包括制度经济学、政治经济学和文化经济学等，并回答了当代重大的经济理论问题，包括李约瑟问题（为何科学和资本主义起源于西欧而非中国）、经济危机的发生机制、中国道路与西方现代化模式的分岔原因，以及如何理解马克思、列宁和毛泽东在不同历史时期对社会主义道路的贡献。
我们对经济发展动力的理解，突破了古典政治经济学的资源、劳力、资本的三要素理论，把生态约束下的技术创新和产业代谢，作为大工业时代经济学的出发点。换言之，邓小平的思想“科学技术是第一生产力”，在我们的代谢经济学框架中可以实现，成为理解资源贫乏的中国得以崛起的经济学机制。
20世纪70年代比利时物理学家普里戈金（Ilya Prigogine）的自组织和耗散结构论，冲击了生物学的还原论，启发我们跨越物理学和经济学的鸿沟。我们在1984—1996年间发现的经济“色混沌”（颜“色”是频率高低的特征，和无特征频率的“白”色噪声形成对比），可以描述多重频率的熊彼特“生物钟”。非平衡统计力学拓展的多峰分布和群体的生灭过程，丰富了非线性计量经济学的武库。经济复杂性的研究深入到宏观、金融、微观和制度经济学等领域。