一般般
大部分生物信息编程的入门书,差不多都有个通病:定位不明确,就是大半部分章节在讲语言的基本要素(当然也不可能讲的很透彻),然而在领域特异的应用和算法上,几乎毫无涉足。诚然,掌握了这些诸如文本编辑和数据库操作以及网络通信的基本用法,大部分应用类的生信编程都包括了,但问题是我为何要在如此多如牛毛的语言入门书中选这本呢?仅仅是因为列举字典的时候用了氨基酸编码??
我个人觉得一本比较好的,比如讲解如何使用Python来进行生物信息应用的入门书籍,可以使用开源的Biopython中的库实现来作为示例,当然不可能做到像成熟的库那样面面俱到,但可以就某个简单功能,给出个原型设计,通过示例来讲解。这方面,我个人觉得只有《Beginning Perl for Bioinformatics》、《Mastering Perl for Bioinformatics》这个系列做的比较好。
我个人觉得一本比较好的,比如讲解如何使用Python来进行生物信息应用的入门书籍,可以使用开源的Biopython中的库实现来作为示例,当然不可能做到像成熟的库那样面面俱到,但可以就某个简单功能,给出个原型设计,通过示例来讲解。这方面,我个人觉得只有《Beginning Perl for Bioinformatics》、《Mastering Perl for Bioinformatics》这个系列做的比较好。
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