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《21世纪高等院校教材•有机化学》共15章，内容可分为两部分。第一部分为基础有机化学及有机波谱学，内容包括有机化学的基础理论、基本有机化合物的类型、命名、结构、理化性质、化学反应以及重要化合物、重要反应机理和立体化学、紫外光谱、红外光谱、核磁共振波谱和质谱。第二部分为天然有机化学，主要介绍油脂、碳水化合物、氨基酸、蛋白质、核酸、含氮和含磷化合物以及杂环化合物和生物碱。
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