现代科研指北

第 1 章　现代科研 .............................................................................1
1.1　科学知识的五个层次 ...................................................................... 2
1.1.1　背景层................................................................................... 2
1.1.2　已知的已知层....................................................................... 3
1.1.3　已知的未知层....................................................................... 4
1.1.4　未知的已知层....................................................................... 4
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第 1 章　现代科研 .............................................................................1
1.1　科学知识的五个层次 ...................................................................... 2
1.1.1　背景层................................................................................... 2
1.1.2　已知的已知层....................................................................... 3
1.1.3　已知的未知层....................................................................... 4
1.1.4　未知的已知层....................................................................... 4
1.1.5　未知的未知层....................................................................... 5
1.2　知识体系的构建 .............................................................................. 6
1.3　认知偏误 .......................................................................................... 7
第 2 章　科研现状概览 ................................................................... 11
2.1　现代社会 ........................................................................................ 12
2.1.1　现代社会的形成................................................................. 12
2.1.2　现代社会的结构................................................................. 19
2.1.3　现代科研的定位................................................................. 26
2.2　研究生教育 .................................................................................... 29
2.2.1　研究生蓄水池..................................................................... 29
2.2.2　毕业延期问题..................................................................... 33
2.2.3　学术职业路径..................................................................... 37
2.2.4　全栈科学家......................................................................... 40
2.2.5　论文八股化......................................................................... 42
2.3　可重复性危机 ................................................................................ 43
2.3.1　零假设显著性检验............................................................. 43
2.3.2　规律性................................................................................. 52
2.3.3　可重复性研究..................................................................... 57
2.4　“掠夺性”期刊 .............................................................................. 59
2.5　公众科学 ........................................................................................ 61
2.6　科普 ................................................................................................ 62
第 3 章　思维工具 ...........................................................................64
3.1　科学哲学 ........................................................................................ 65
3.1.1　古希腊................................................................................. 66
3.1.2　中世纪................................................................................. 67
3.1.3　文艺复兴之后..................................................................... 68
3.1.4　逻辑实证主义..................................................................... 70
3.1.5　否证主义............................................................................. 71
3.1.6　历史主义............................................................................. 72
3.1.7　无政府主义......................................................................... 73
3.1.8　实用主义............................................................................. 74
3.1.9　其他..................................................................................... 74
3.2　数学思维 ........................................................................................ 75
3.3　统计思维 ........................................................................................ 78
3.3.1　抽象..................................................................................... 78
3.3.2　似然度................................................................................. 79
3.3.3　回归..................................................................................... 80
3.3.4　因果..................................................................................... 84
3.3.5　残差..................................................................................... 96
3.4　模型思维 ........................................................................................ 97
3.4.1　编程..................................................................................... 97
3.4.2　决策模型........................................................................... 103
3.4.3　个体 - 整体模型............................................................... 104
3.4.4　动力学模型........................................................................111
3.5　启发法 .......................................................................................... 112
第 4 章　实验 ................................................................................ 115
4.1　思想实验 ...................................................................................... 117
4.2　仿真实验 ...................................................................................... 122
4.3　观察实验 ...................................................................................... 123
4.4　控制实验 ...................................................................................... 124
4.5　因素选择 ...................................................................................... 125
4.6　效应指标 ...................................................................................... 126
4.7　采样与样品预处理 ...................................................................... 128
4.8　预实验 .......................................................................................... 129
4.9　质量保证 / 质量控制 ................................................................... 136
第 5 章　数据处理 .........................................................................139
5.1　探索性数据分析 .......................................................................... 140
5.2　统计推断 ...................................................................................... 145
5.3　线性模型 ...................................................................................... 162
5.4　模型组合 ...................................................................................... 167
5.5　计算方法 ...................................................................................... 169
5.5.1　并行计算........................................................................... 169
5.5.2　容器技术........................................................................... 170
5.5.3　云....................................................................................... 171
5.6　主成分分析 .................................................................................. 171
第 6 章　文献 ................................................................................179
6.1　文献管理 ...................................................................................... 180
6.1.1　从无到有........................................................................... 180
6.1.2　从有到精........................................................................... 181
6.1.3　从精到用........................................................................... 183
6.2　文本挖掘 ...................................................................................... 185
6.2.1　关键词............................................................................... 185
6.2.2　作者................................................................................... 192
6.3　全学科评价 .................................................................................. 193
6.4　荟萃分析 ...................................................................................... 196
第 7 章　学术生活 .........................................................................199
7.1　学术道德与伦理 .......................................................................... 200
7.1.1　剽窃................................................................................... 200
7.1.2　文章挂名........................................................................... 201
7.1.3　双重发表........................................................................... 202
7.1.4　数据造假........................................................................... 202
7.1.5　有害研究实践................................................................... 202
7.1.6　合规性............................................................................... 203
7.1.7　性骚扰............................................................................... 203
7.1.8　歧视................................................................................... 203
7.1.9　伦理................................................................................... 204
7.2　邮件 .............................................................................................. 205
7.3　学术出版 ...................................................................................... 206
7.3.1　期刊 / 论文 ....................................................................... 206
7.3.2　会议摘要........................................................................... 212
7.3.3　专著................................................................................... 213
7.3.4　专利................................................................................... 213
7.3.5　软件................................................................................... 214
7.4　学术会议 ...................................................................................... 214
7.4.1　口头报告........................................................................... 214
7.4.2　海报报告........................................................................... 216
7.4.3　电梯报告........................................................................... 216
7.4.4　听报告............................................................................... 217
7.4.5　主持报告........................................................................... 217
7.5　审稿 .............................................................................................. 217
7.6　学术合作 ...................................................................................... 219
7.7　利益冲突 ...................................................................................... 220
7.7.1　数据共享........................................................................... 220
7.7.2　社交网络........................................................................... 221
7.8　学术评价 ...................................................................................... 221
7.9　课题组管理 .................................................................................. 223
7.9.1　课题组规章（示例）......................................................... 223
7.9.2　实验室规章（示例）......................................................... 226
7.9.3　项目管理........................................................................... 227
7.9.4　经费管理........................................................................... 230
7.9.5　心理辅导........................................................................... 232
7.10　讲课 ............................................................................................ 233
7.10.1　了解学生如何学习......................................................... 233
7.10.2　如何激励学生................................................................. 233
7.10.3　评价学习......................................................................... 234
7.10.4　课程设计......................................................................... 234
7.10.5　互动学习......................................................................... 235
7.10.6　教学理念......................................................................... 235
第 8 章　就业 ................................................................................236
8.1　商业与学术 .................................................................................. 237
8.2　简历 .............................................................................................. 238
8.3　人脉 .............................................................................................. 239
8.4　面试 .............................................................................................. 241
8.5　职场 .............................................................................................. 243
8.6　职业 .............................................................................................. 244
8.6.1　博士后............................................................................... 244
8.6.2　常任轨............................................................................... 245
8.6.3　非常任轨........................................................................... 245
8.6.4　非高等教育....................................................................... 246
8.6.5　科学顾问........................................................................... 246
8.6.6　科学传播........................................................................... 247
8.6.7　政府公务员....................................................................... 248
8.6.8　非营利组织与基金会....................................................... 248
8.6.9　编辑 / 出版社 ................................................................... 249
8.6.10　应用专家及销售............................................................. 249
8.6.11　企业科研 / 药企 .............................................................. 250
8.6.12　医药交流......................................................................... 250
8.6.13　咨询................................................................................. 250
8.6.14　金融................................................................................. 251
8.6.15　数据科学家..................................................................... 251
8.6.16　创业................................................................................. 252
附录 A 现代科研兵刃谱 ..............................................................253
附录 B 全栈科学家自测题 ...........................................................263
附录 C 科学问题 ...........................................................................268
· · · · · · (收起)