本书设二级结构，共分四编。第一编：医经（内经、难经）、伤寒金匮、本草、养生、医史；第二编：藏象、运气、病因病机、针灸推拿、经络骨度、诊法、方书；第三编：通论、内科、外科、伤科、女科、儿科、温病、眼科、咽喉口齿、医案医话、丛书；第四编：藏医、蒙医、维吾尔医、傣医、彝医。《丛书卷》收录丛书类代表性典籍27部，本书为《己任编》。《己任编》成于清雍正三年，共八卷，系杨乘六辑评明末清初医家高鼓峰《四明心法》三卷、《四明医案》一卷、吕留良《东庄医案》一卷、董废翁《西塘感症》三卷，乃三家四部医书汇共之编，总名“己任”寓“以天下为己任”之意，又名《医宗己任编》。
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