第8～10章 与微生物互动

细菌正生活在这样的世界之中。它们可以像交换电话号码、金钱或想法般轻松地交换DNA。有时它们会侧身靠近，创建一个物理链接，然后在彼此间“运输”DNA：这一过程就相当于它们在交配。它们还可以从周围的环境中捡起其他有机体因为死亡或者腐烂而丢弃的DNA。它们甚至可以依靠病毒把基因从一个细胞转移到另一个细胞。……细菌一直在进行基因的水平转移（简称HGT）。（P171）

HGT允许细菌以惊人的速度演化。当面临新的挑战时，它们不必等待正确的突变在现有的DNA中慢慢积累，它们从已经适应环境挑战的细菌中获取基因，从而纳入整个适应过程。

日本食客仅靠食用海苔就从海洋中获得了一整套消化基因，完成了令人难以置信的从海洋到陆地的演化之旅。基因从海洋微生物中水平地移动到肠道微生物中，再垂直地从一代人的肠道遗传到下一代人。（P175）
不能指望相同的益生菌菌株或供体粪便能够治疗各种疾病。更好的方法，是根据每个个体生态系统中的缺陷、免疫系统的怪癖或遗传易感的疾病而定制益生菌。

医生需要同时治疗患者和他们的微生物。炎性肠症患者若服用抗炎药，其体内的微生物组可能只会把人体送回同样的炎症状态；若是选择益生菌或粪便移植，那么新的微生物可能无法在发炎的肠子里落脚。如果吃下一种高纤维的益生元饮食，那么首先面临的局面是缺乏消化纤维的微生物，症状可能会更糟。零星的解决方案不起作用，就像人们不会只通过引入适当的动物或植物来修复受损的珊瑚礁或裸露的草地：可能还需要移除入侵物种或控制营养物质的流入。我们的身体也是如此。必须针对整个生态系统——宿主微生物、营养素，一切的一切，多管齐下。
在进入新地方的24小时内，我们便用自己的微生物覆盖了这些地方，把它们变成自身的映射。

过度清洁会导致水族箱环境中的微生物被剥离，无法形成一个成熟、多样的微生物菌群，并为海藻或其他有害物种创造了生存机会。……消毒成了灾难而非目标，一个多元化的生态系统要优于贫瘠的生态系统。

室外空气中充满了来自植物和土壤的无害微生物，室内空气中则含有大量不成比例的潜在病原体，主要来自患者的口腔和皮肤，通常在室外非常罕见。……新鲜空气会带来无害的环境微生物，占据病原体的生存空间。

所有的努力都出自好奇心，出于对生命的敬畏，以及探索的预约。